سازمان نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران، سازمانی است مستقل و دارای شخصیت حقوقی که به منظور تحقق بخشیدن به اهداف ذیل تشکیل و در حال فعالیت می باشد:
الف) تلاش در جهت تحقق بخشیدن به ارزش های عالی اسلامی در کلیه امور پزشکی
ب) تلاش در جهت پیشبرد و اصلاح امور پزشکی
ج) مشارکت در جهت ارتقای سطح دانش پزشکی
د) حفظ و حمایت از حقوق بیماران
ه) حفظ و حمایت از حقوق صنفی شاغلان حرف پزشکی
و) تنظیم روابط شاغلین حرف پزشکی با دستگاههای ذیربط در جهت حسن اجرای موازین و مقررات مربوط به امور پزشکی

در این راستا سازمان نظام پزشکی در شهرستان لنجان نیز از سال ۱۳۷۰ و پس از برگزاری اولین انتخابات هیات مدیره ها در کشور بدنبال تصویب قانون نظام پزشکی در مجلس شورای اسلامی، فعالیت خود را آغاز نمود. محل استقرار سازمان ابتدا در بیمارستان شهید مطهری فولاد شهر و پس از آن به ترتیب در ساختمان ستاد شبکه بهداشت، مرکز بهداشتی درمانی شماره ۳ زرین شهر و از سال ۱۳۸۵ در ساختمانی استیجاری واقع در خیابان شهید باهنر زرین شهر قرار داشت.
در سال ۱۳۹۸ به همت اعضای هیات مدیره دوره هفتم ،ساختمان خریداری شده به نام سازمان نظام پزشکی لنجان بازسازی و در هجدهم بهمن ماه ۱۳۹۸ با حضور ریاست کل سازمان نظام پزشکی جمهوری اسلامی ایران جناب آقای دکتر محمدرضا ظفرقندی افتتاح و رسما مورد بهره برداری قرار گرفت.
در حال حاضر کلیه فعالیت های جاری سازمان شامل رسیدگی به درخواست های اداری اعضا ، صدور پروانه فعالیت حرفه ای ، برگزاری جلسات هیات مدیره، هیات بدوی انتظامی و کمیسیون تبلیغات در ساختمان فعلی واقع در خیابان شهید آیت الله دستغیب زرین شهر انجام می گیرد.